CodonCode Aligner

Descrizione

CodonCode Aligner è un software intuitivo per l'assemblaggio di sequenze di DNA, l'allineamento, la modifica dei contig e il rilevamento delle mutazioni. Aligner è compatibile con Phred-Phrap e supporta pienamente i punteggi di qualità delle sequenze, offrendo al contempo un'interfaccia utente familiare e di facile apprendimento. Le funzionalità includono l'importazione di sequenze da file di testo, l'allineamento dei contig tra loro mantenendo i collegamenti alle tracce, la ricerca di mutazioni eterozigoti, la definizione di regioni di interesse ("caratteristiche"), l'importazione e la modifica di assiemi generati da Phrap, l'esportazione di sequenze e funzionalità, l'importazione di sequenze da file ABI e SCF, ritaglia il vettore, allinea a una sequenza di riferimento, analizza inserimenti ed eliminazioni eterozigoti, naviga tra le funzioni definite dall'utente ed esporta progetti di assieme compatibili con Consed.