| Versione | 1.01 |
|---|---|
| Editore | Paul A. Wilson |
| Data di rilascio | 25 ago 2008 |
| Data aggiunta | 11 ago 2004 |
| Requisiti del sistema operativo | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Requisiti | Mac OS X 10.3 |
| Download totali | 29 |
| Prezzo | Free |
Descrizione
Strumento a riga di comando per confrontare file di dati delimitati da virgole utilizzando differenze relative per determinare le conformazioni più simili. Compsort confronta i file di dati utilizzando la differenza relativa, calcola un punteggio di somiglianza, ordina i punteggi in ordine crescente (valori inferiori rappresentano una maggiore somiglianza), salva X numero di punteggi bassi.
I file di dati prodotti dall'utente, devono essere file di testo delimitati da virgole. Ogni file rappresenta una molecola unica. Ogni riga in un file rappresenta una conformazione unica della molecola. La prima colonna nel file di dati deve essere un'etichetta univoca per la conformazione rappresentata dalla riga. Il resto delle colonne sono descrittori numerici, come le misurazioni dello spazio della distanza.
Le righe vengono confrontate in modo combinatorio tra i file. Le etichette a confronto vengono concatenate e salvate con i punteggi per l'insieme di righe. Questo fornisce un modo per identificare le conformazioni che hanno prodotto un dato punteggio di somiglianza.
Il lavoro futuro include:
aggiunta dell'interfaccia GUI
pubblicazione di articoli sul mio algoritmo di modellazione del farmacoforo 3D
Una versione parallela che utilizza MPI
