Juicebox VR for Android APK

Descrizione

Juicebox VR crea una rappresentazione in realtà virtuale dei dati generati dal metodo Hi-C per il sequenziamento tridimensionale del genoma. Ogni posizione 2D nel paesaggio corrisponde a una coppia di posizioni 1D, o loci, nel genoma umano lungo tre miliardi di lettere. L'altezza nella posizione 2D rappresenta la frequenza con cui i due loci sono in contatto nel nucleo di una cellula. Poiché i loci vicini spesso si scontrano l'uno con l'altro, un massiccio "muro" di contatti a corto raggio divide in due il paesaggio. Gli altipiani quadrati che si staccano dalla diagonale corrispondono a domini genomici condensati, chiamati domini di contatto. I picchi nel paesaggio corrispondono ad anelli nel genoma. I domini di contatto sono spesso delimitati da loop, motivo per cui i domini quadrati hanno spesso dei picchi nel loro angolo. Il controller volerà in qualsiasi direzione guardi. Guarda dritto per un super salto.Juicebox VR è stato creato da Muhammad Shamim, Ido Machol ed Erez Lieberman Aiden. I dati sono tratti da: Suhas Rao*, Miriam Huntley*, Neva C. Durand, Elena Stamenova, Ivan Bochkov, Jim Robinson, Adrian Sanborn, Ido Machol, Arina Omer, Eric Lander e Erez Lieberman Aiden. A 3D Map of the Human Genome at Kilobase Resolution Reveals Principles of Chromatin Looping, Cell (2014).* ha contribuito allo stesso modo. Nota che i dati utilizzati per generare il paesaggio sono una regione estremamente piccola da una mappa completa dell'intero genoma. La mappa completa dei contatti per il genoma umano è un trilione di volte più grande di questa mappa. Ulteriori informazioni sul nostro lavoro su www.aidenlab.org. Musica: Ascent di StellardroneIMPORTANTE: Per visualizzare correttamente l'app, un visore per la realtà virtuale, come Google Cardboard , Durovis Dive o Samsung Gear VR dovrebbero essere utilizzati. Classificazione dei contenuti: Tutti