MultiGeneBlast

Descrizione

MultiGeneBlast è uno strumento open source basato su una riformattazione delle intestazioni FASTA delle voci della proteina GenBank dell'NCBI, utilizzando il quale può rintracciare il nucleotide e le coordinate di origine. MultiGeneBlast può aiutare nel rilevamento di tali parti multigene per progetti di biologia sintetica. Una libreria sintetica di operoni può essere creata in base al suo output per identificare quegli operoni la cui funzione è più vicina a quella desiderata dall'utente. Questo strumento offre l'opportunità di identificare tutte le regioni genomiche omologhe combinando i risultati di singole esecuzioni BlastP su ciascun gene e ordinando le regioni genomiche da qualsiasi voce GenBank in base al numero di hit, alla conservazione della sintesi e al punteggio cumulativo dei bit Blast. È possibile eseguire ricerche sull'architettura per trovare qualsiasi regione genomica con risultati Blast su qualsiasi combinazione di sequenze di amminoacidi specificata dall'utente.