MD simulation for iPhone

Descrizione

Università di Ulsan, Scuola di Ingegneria Meccanica, Laboratorio MNTF (Micro/Nano-scale Thermo-Fluids Engineering). http://home2.ulsan.ac.kr/user/nanofluid/ Segui i tutorial di seguito per alcuni casi di esempio. Tutti gli esempi seguenti presuppongono gli stati iniziali dopo la schermata di caricamento. (regolare Dt per vedere il risultato più velocemente. Provare anche quelli con [WCA] e [Ideal]) 1. Simulazione flusso Couette [Start] -attendere che il sistema raggiunga l'equilibrio- [Couette] - attendere che il sistema raggiunga il stato stazionario (profili di velocità istantanea disponibili nel riquadro grigio in basso a destra) 2. Simulazione del flusso di Poiseuille [Start] - attendere che il sistema raggiunga l'equilibrio - [Poiseuille]- attendere che il sistema raggiunga lo stato stazionario 3. Diffusione simulazione [Init3,4,5] - imposta la temperatura target intorno a 250~350K - [start] 4. Simulazione di congelamento e cristallizzazione [Init3,4,5] - imposta la temperatura target inferiore a 80K - [start] 5. Altri suggerimenti! Il pulsante [Start] imposta le distribuzioni di velocità di Maxwell-Boltzmann su ogni molecola di fluido. ! [L-J] è per il potenziale VDW basato sul parametro molecolare di Argon, [WCA] è un'interazione intermolecolare puramente repulsiva e [Ideal] trascura le dimensioni delle molecole e le collisioni come presuppone la legge dei gas ideali. ! È possibile aumentare il passo temporale (Dt) per rendere le simulazioni più veloci, ma ciò potrebbe causare l'interruzione delle simulazioni e il ripristino. ! Quando la simulazione viene ripristinata, la temperatura target e il passo temporale (Dt) vengono impostati sul valore più basso possibile. ! È possibile modificare la temperatura target durante le simulazioni e regolare la temperatura attuale utilizzando il termostato. ! È possibile avviare le simulazioni in varie condizioni iniziali utilizzando il pulsante [Init] ! Il pulsante [T/Tt] imposta il termostato sul sistema con la temperatura target. Il tag "ROSSO" indica il termostato di ridimensionamento della velocità e il tag "ARANCIONE" indica il termostato Nose-Hoover. ***Dinamica molecolare nel fluido di argon dell'iPhone nel canale a 5 nm Negli ultimi due decenni, il rivoluzionario progresso delle risorse di calcolo ad alte prestazioni ha portato gli studi di Molecular Dynamics (MD) sulla modellazione a livello atomistico nei personal computer desktop. Ora sto espandendo le piattaforme MD ai potenti dispositivi di elaborazione mobili disponibili (iPhone) e questo potrebbe essere il primo tentativo nella storia di MD. I flussi di fluidi in domini su scala micron e nanometrica si incontrano frequentemente nei componenti di sistemi microelettromeccanici, dispositivi microfluidici e nei dischi rigidi dei computer. Ad esempio, per i sistemi a disco rigido, la distanza tra la testina e il supporto è dell'ordine di decine di nanometri. Il flusso del fluido in scale così piccole non può essere descritto utilizzando l'ipotesi del continuo. La dinamica molecolare può potenzialmente affrontare questioni come le interfacce/interazione solido-fluido che sorgono nel regime di nanoscala. Inoltre, simulazioni su larga scala basate su modelli atomistici possono anche affrontare il passaggio dall'approccio atomistico a quello su scala continua. Questo è un codice di dinamica molecolare (MD) (i2DMD) in esecuzione su iPhone. Questo codice ha la maggior parte delle caratteristiche (ma semplificate per la visualizzazione e per scopi didattici) del codice MD effettivo utilizzato per le mie pubblicazioni nelle riviste SCI elencate nel collegamento informativo. È possibile simulare il flusso di Couette, il flusso di Poiseuille, la diffusione e il congelamento dell'argon in un canale a 5 nm con condizioni al contorno periodiche. Spero che questo codice di esempio possa aiutare le persone a comprendere il molecolare su scala nanometrica