Ascalaph Designer

Descrizione

Ascalaph Designer è un programma generico per simulazioni dinamiche molecolari. In un unico ambiente grafico sono rappresentate le proprie implementazioni della dinamica molecolare così come i metodi della meccanica classica e quantistica dei programmi popolari. Le caratteristiche includono grafica molecolare: finestre multiple, due telecamere per modello, stili CPK, Wire frame, Stick, Ball and Stick e CPK Wire frame, costruzione di modelli molecolari: costruttore di cristalli, generatore di catene, disegno con il mouse, modifica della geometria molecolare, ottimizzazione preliminare , ottimizzazione quantistica e rimozione dei conflitti, ottimizzazione della geometria molecolare con metodi del gradiente coniugato, dinamica molecolare: integrazione di più fasi temporali, integrazione del quarto ordine, calcoli di supercomputer con l'aiuto di MDynaMix, modello dell'acqua SPC flessibile e modello dell'acqua implicito e chimica quantistica con l'aiuto di CP2K e PC GAMESS/Firefly: energia, ottimizzazione della geometria molecolare e potenziali cariche derivate.