POY

Descrizione

POY è un programma di analisi filogenetica che supporta più tipi di dati (ad es. morfologia, nucleotidi, geni e regioni geniche, cromosomi e interi genomi). POY è particolare in quanto può eseguire il vero allineamento e l'inferenza filogenetica, ovvero le sequenze di input non devono essere preallineate. Inserzioni, eliminazioni e riarrangiamenti possono quindi essere inclusi nel punteggio complessivo dell'albero in Massima parsimonia o nel modello in Massima verosimiglianza. A tale scopo sono stati sviluppati numerosi algoritmi euristici, implementati in POY.