ImageSurfer

Descrizione

ImageSurfer è un programma di imaging 3D gratuito per microcopia. Consente agli investigatori di visualizzare e analizzare i volumi 3D e 4D (time-lapse) multicanale. ImageSurfer fornisce diversi strumenti di ripristino delle immagini, inclusi algoritmi di deconvoluzione (filtro Wiener, iterativo vincolato e massima probabilità) per rimuovere la sfocatura introdotta dal sistema di imaging. Per la visualizzazione, ImageSurfer fornisce diverse tecniche di rendering del volume e della superficie. Il software dispone inoltre di un'innovativa modalità isosurface colorata che fornisce una visualizzazione qualitativa della corrispondenza tra due canali.

Un "estrattore di fette" consente all'utente di esaminare una sezione trasversale del volume presa con qualsiasi orientamento. La sezione acquisita può essere visualizzata come un'immagine 2D tradizionale o come una rappresentazione in rilievo 3D in cui l'intensità dell'immagine è codificata come altezza. Per sondare ulteriormente la sovrapposizione spaziale tra le strutture, l'investigatore può utilizzare i dati di un altro canale per colorare la rappresentazione del rilievo 3D. Per la quantificazione, i valori di intensità del segnale possono quindi essere campionati all'interno di sezioni acquisite lungo una spline definita dall'utente. Oltre a scattare istantanee di rappresentazioni 3D e generare filmati, i modelli 3D possono anche essere esportati come file OBJ o VRML (linguaggio di modellazione della realtà virtuale); I file VRML possono essere visualizzati nei browser Web utilizzando un plug-in gratuito. Entrambi i tipi di file possono essere importati nei più diffusi programmi di rendering 3D per un'ulteriore elaborazione e in Acrobat 3D per produrre documenti che possono essere visualizzati in modo interattivo con Adobe Reader 8.